Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm10477F6SW83 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm10477F6SW83 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm10477F6SW83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm10477F6SW83 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm10477F6SW83 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm10477F6SW83 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm10477F6SW83 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms