Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Syngap1F6SEU4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Syngap1F6SEU4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syngap1F6SEU4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syngap1F6SEU4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syngap1F6SEU4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syngap1F6SEU4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syngap1F6SEU4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syngap1F6SEU4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Syngap1F6SEU4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Syngap1F6SEU4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Syngap1F6SEU4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syngap1F6SEU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syngap1F6SEU4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syngap1F6SEU4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms