Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm340F6RGI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm340F6RGI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm340F6RGI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm340F6RGI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm340F6RGI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm340F6RGI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm340F6RGI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm340F6RGI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm340F6RGI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm340F6RGI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm340F6RGI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm340F6RGI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm340F6RGI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm340F6RGI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm340F6RGI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms