Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srsf11E9Q6E5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srsf11E9Q6E5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srsf11E9Q6E5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Srsf11E9Q6E5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srsf11E9Q6E5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srsf11E9Q6E5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srsf11E9Q6E5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srsf11E9Q6E5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srsf11E9Q6E5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms