Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pgbd1E9Q492 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgbd1E9Q492 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pgbd1E9Q492 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgbd1E9Q492 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgbd1E9Q492 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgbd1E9Q492 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms