Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krtap11-1E9Q2E9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krtap11-1E9Q2E9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms