Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5286E0CXI6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5286E0CXI6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5286E0CXI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5286E0CXI6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5286E0CXI6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5286E0CXI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5286E0CXI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm5286E0CXI6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5286E0CXI6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5286E0CXI6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5286E0CXI6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5286E0CXI6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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