Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn2r49D3Z6L3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r49D3Z6L3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r49D3Z6L3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r49D3Z6L3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vmn2r49D3Z6L3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn2r49D3Z6L3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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