Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf217D3YYI7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf217D3YYI7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf217D3YYI7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf217D3YYI7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf217D3YYI7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf217D3YYI7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms