Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samd1D3YXK1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Samd1D3YXK1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Samd1D3YXK1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Samd1D3YXK1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Samd1D3YXK1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Samd1D3YXK1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms