Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl10D3YWW5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtl10D3YWW5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtl10D3YWW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl10D3YWW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl10D3YWW5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl10D3YWW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms