Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apol6B7ZC55 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apol6B7ZC55 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Apol6B7ZC55 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apol6B7ZC55 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Apol6B7ZC55 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apol6B7ZC55 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Apol6B7ZC55 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apol6B7ZC55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apol6B7ZC55 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apol6B7ZC55 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apol6B7ZC55 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol6B7ZC55 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol6B7ZC55 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol6B7ZC55 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms