Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cped1B2RX70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cped1B2RX70 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cped1B2RX70 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cped1B2RX70 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cped1B2RX70 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cped1B2RX70 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cped1B2RX70 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cped1B2RX70 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cped1B2RX70 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cped1B2RX70 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cped1B2RX70 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cped1B2RX70 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cped1B2RX70 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cped1B2RX70 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms