Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrn3B2RS91 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrn3B2RS91 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrn3B2RS91 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrn3B2RS91 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrn3B2RS91 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrn3B2RS91 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrn3B2RS91 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrn3B2RS91 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrn3B2RS91 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrn3B2RS91 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrn3B2RS91 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrn3B2RS91 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrn3B2RS91 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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