Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbed5B2RPU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbed5B2RPU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbed5B2RPU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbed5B2RPU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbed5B2RPU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed5B2RPU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Zbed5B2RPU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbed5B2RPU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed5B2RPU8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed5B2RPU8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed5B2RPU8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbed5B2RPU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed5B2RPU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms