Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nipsnap3aB1AWZ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nipsnap3aB1AWZ3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nipsnap3aB1AWZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms