Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Proca1B0QZF7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Proca1B0QZF7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Proca1B0QZF7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Proca1B0QZF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Proca1B0QZF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Proca1B0QZF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Proca1B0QZF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms