Protein–RNA interactions for Protein: A6H6E9

Ttc23l, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23lA6H6E9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc23lA6H6E9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc23lA6H6E9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc23lA6H6E9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc23lA6H6E9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc23lA6H6E9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc23lA6H6E9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc23lA6H6E9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc23lA6H6E9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc23lA6H6E9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc23lA6H6E9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc23lA6H6E9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc23lA6H6E9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc23lA6H6E9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc23lA6H6E9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc23lA6H6E9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc23lA6H6E9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc23lA6H6E9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc23lA6H6E9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc23lA6H6E9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc23lA6H6E9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc23lA6H6E9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc23lA6H6E9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc23lA6H6E9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc23lA6H6E9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc23lA6H6E9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc23lA6H6E9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc23lA6H6E9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc23lA6H6E9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc23lA6H6E9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc23lA6H6E9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms