Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Btbd35f28A2CFD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Btbd35f28A2CFD5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Btbd35f28A2CFD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Btbd35f28A2CFD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Btbd35f28A2CFD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Btbd35f28A2CFD5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms