Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl41A2AUC9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhl41A2AUC9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhl41A2AUC9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl41A2AUC9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl41A2AUC9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klhl41A2AUC9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhl41A2AUC9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl41A2AUC9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl41A2AUC9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl41A2AUC9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl41A2AUC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl41A2AUC9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl41A2AUC9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl41A2AUC9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms