Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pramef17A2ASJ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pramef17A2ASJ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pramef17A2ASJ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pramef17A2ASJ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pramef17A2ASJ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pramef17A2ASJ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pramef17A2ASJ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pramef17A2ASJ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pramef17A2ASJ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pramef17A2ASJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pramef17A2ASJ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pramef17A2ASJ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pramef17A2ASJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pramef17A2ASJ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pramef17A2ASJ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pramef17A2ASJ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pramef17A2ASJ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pramef17A2ASJ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pramef17A2ASJ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms