Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lgr4A2ARI4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr4A2ARI4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lgr4A2ARI4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgr4A2ARI4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lgr4A2ARI4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr4A2ARI4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr4A2ARI4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms