Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syndig1A2ANU3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syndig1A2ANU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Syndig1A2ANU3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syndig1A2ANU3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syndig1A2ANU3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syndig1A2ANU3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms