Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin3aA2AIR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin3aA2AIR5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin3aA2AIR5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin3aA2AIR5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin3aA2AIR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin3aA2AIR5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin3aA2AIR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms