Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
PtprfA2A8L5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
PtprfA2A8L5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,72
PtprfA2A8L5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,75■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
PtprfA2A8L5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,66■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,65■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
PtprfA2A8L5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,58■■□□□ 1,69
PtprfA2A8L5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,57■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
PtprfA2A8L5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
PtprfA2A8L5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
PtprfA2A8L5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
PtprfA2A8L5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
PtprfA2A8L5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
PtprfA2A8L5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
PtprfA2A8L5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
PtprfA2A8L5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
PtprfA2A8L5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
PtprfA2A8L5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
PtprfA2A8L5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
PtprfA2A8L5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
PtprfA2A8L5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
PtprfA2A8L5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms