Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprfA2A8L5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprfA2A8L5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PtprfA2A8L5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprfA2A8L5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprfA2A8L5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprfA2A8L5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprfA2A8L5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprfA2A8L5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprfA2A8L5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprfA2A8L5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprfA2A8L5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprfA2A8L5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprfA2A8L5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprfA2A8L5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprfA2A8L5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprfA2A8L5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprfA2A8L5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprfA2A8L5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprfA2A8L5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprfA2A8L5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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