Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Calcoco2A2A6M5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Calcoco2A2A6M5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Calcoco2A2A6M5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Calcoco2A2A6M5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Calcoco2A2A6M5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calcoco2A2A6M5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calcoco2A2A6M5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calcoco2A2A6M5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calcoco2A2A6M5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calcoco2A2A6M5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calcoco2A2A6M5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calcoco2A2A6M5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calcoco2A2A6M5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calcoco2A2A6M5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms