Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pabpc1lA2A5N3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pabpc1lA2A5N3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pabpc1lA2A5N3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pabpc1lA2A5N3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pabpc1lA2A5N3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pabpc1lA2A5N3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pabpc1lA2A5N3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pabpc1lA2A5N3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pabpc1lA2A5N3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pabpc1lA2A5N3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pabpc1lA2A5N3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pabpc1lA2A5N3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pabpc1lA2A5N3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc1lA2A5N3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc1lA2A5N3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc1lA2A5N3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc1lA2A5N3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pabpc1lA2A5N3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pabpc1lA2A5N3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pabpc1lA2A5N3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pabpc1lA2A5N3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pabpc1lA2A5N3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms