Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp1bA1Z198 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp1bA1Z198 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp1bA1Z198 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp1bA1Z198 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp1bA1Z198 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp1bA1Z198 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp1bA1Z198 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp1bA1Z198 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp1bA1Z198 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1bA1Z198 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1bA1Z198 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp1bA1Z198 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp1bA1Z198 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1bA1Z198 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp1bA1Z198 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms