Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc173A0JLY1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc173A0JLY1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc173A0JLY1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc173A0JLY1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc173A0JLY1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc173A0JLY1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc173A0JLY1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc173A0JLY1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc173A0JLY1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc173A0JLY1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc173A0JLY1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc173A0JLY1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc173A0JLY1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc173A0JLY1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc173A0JLY1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms