Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Cc2d2bA0A286YDU8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Cc2d2bA0A286YDU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Cc2d2bA0A286YDU8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Cc2d2bA0A286YDU8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Cc2d2bA0A286YDU8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Cc2d2bA0A286YDU8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cc2d2bA0A286YDU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cc2d2bA0A286YDU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cc2d2bA0A286YDU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cc2d2bA0A286YDU8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cc2d2bA0A286YDU8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Cc2d2bA0A286YDU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cc2d2bA0A286YDU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cc2d2bA0A286YDU8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cc2d2bA0A286YDU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Cc2d2bA0A286YDU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cc2d2bA0A286YDU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cc2d2bA0A286YDU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Cc2d2bA0A286YDU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cc2d2bA0A286YDU8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms