Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDL3

2310034G01Rik, RIKEN cDNA 2310034G01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310034G01RikA0A286YDL3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2310034G01RikA0A286YDL3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2310034G01RikA0A286YDL3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2310034G01RikA0A286YDL3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2310034G01RikA0A286YDL3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2310034G01RikA0A286YDL3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310034G01RikA0A286YDL3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2310034G01RikA0A286YDL3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2310034G01RikA0A286YDL3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2310034G01RikA0A286YDL3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310034G01RikA0A286YDL3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310034G01RikA0A286YDL3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310034G01RikA0A286YDL3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310034G01RikA0A286YDL3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310034G01RikA0A286YDL3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310034G01RikA0A286YDL3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms