Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sycp2lA0A0M3U1B0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sycp2lA0A0M3U1B0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms