Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22,03■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Trbv2A0A0B4J1G8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trbv2A0A0B4J1G8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Trbv2A0A0B4J1G8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trbv2A0A0B4J1G8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trbv2A0A0B4J1G8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trbv2A0A0B4J1G8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Trbv2A0A0B4J1G8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,63■■□□□ 1,05
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