Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VhlP40338 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VhlP40338 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms