Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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