Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf17Q99MV7 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf17Q99MV7 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf17Q99MV7 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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