Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PrcdQ00LT2 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms