Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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