Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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