Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms