Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms