Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms