Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb6Q9Z0T9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms