Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srd5a3Q9WUP4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms