Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn5Q9WU28 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms