Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed2Q9R0Q3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms