Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fhl3Q9R059 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fhl3Q9R059 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fhl3Q9R059 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms