Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf1Q9QX66 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf1Q9QX66 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms