Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk3Q9QUN9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk3Q9QUN9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms