Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Alyref2Q9JJW6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Alyref2Q9JJW6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Alyref2Q9JJW6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Alyref2Q9JJW6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Alyref2Q9JJW6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Alyref2Q9JJW6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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